Der ehrwürdige Chemiker Dr. Staub experimentiert mit dem Molekularis, um es schwieriger zu machen. Mithilfe eines Supraquantenmagnetfelds gelingt es ihm, das Rätsel zu ionisieren! Neben Regel 1. und 2., welche weiterhin gültig sind, gibt es drei zusätzliche Regeln für den ionisierten Zustand:
3. Jedes Atom kann einfach negativ geladen sein. In diesem Falle verringert sich die Anzahl der Verbindungen dieses Atoms um eins.
4. Zwei geladene Atome sind nie benachbart (wegen der Abstoßungskraft).
5. Ein geladenes Atom hat nur Verbindungen mit einem seiner Nachbarn.